Bioinformatics for Genomic Medicine : 유전체정보의학

책임교수: 김주한

강의시간: 매주 월요일 오후 2:00 ~ 5:00

강의장소: 의대본관 310호

공지사항: B4GM2006 게시판

조교: 김도균 (8318, davefriend99@gmail.com)

Date	Type	Issues	Lecturer	Readings
03월 13일		Administriva	김주한
	Lecture	Introduction
03월 20일	Book reading	1 생명의 청사진	김윤경 김경원
	Lecture	Internet Resources and Databases	김주한
03월 27일	Book reading	2-1 분자생물학 데이터베이스	정용진 이영애
	Lecture	Emerging Genomic Technologies	김주한
04월 03일	Book reading	2-2 정보공학	나영지 정용
	Lecture	Database Theory	김주한
04월 10일	Book reading	2-3 분자생물학 데이터베이스의 새로운 세대	정희준 김현정
	Lecture	Normalization / Clustering	김주한
04월 17일	Book reading	3-1 유사성 검색	김도균 김윤경
	Lecture	Unsupervised Learning	김주한
04월 24일	Term Project proposal	Term Project Proposal Presentation
		Gene Expression Profile in Proliferation and Apoptosis of Human Hepatic Stellate Cell Using Microarray	신혜원
		Multicenter database of clinical course of CKD patients	장혜련
		OMIM DB를 이용한 피부 유전성 질환 DB의 구축	김윤경
		Importing GEO data into MIAME format-based information System	정용
		Predicting chromosome instability in cancer using gene expression data and location information	김도균
		Identification of microRNA function by target prediction and expression profiling	이영애
		약인성 간염 진단 DB 구축	정용진
		Meta-analysis : breast cancer-related pathway study	나영지
		Extension of disease-related pathway using text mining	정희준
		시험관 아기시술(IVF) 기록의 DB화	문정희
		갑상선암 데이터베이스 구축	김경원

05월 01일	Book reading	3-2 구조 및 기능 예측	정용진
	Lecture	Differential Expression	김주한
05월 08일	Lecture	특강 Ontology Computing	김홍기
	Lecture	Mulitple Hypothesis Testing	김주한
05월 15일	Book reading	4-1 네트워크 표현과 연산	정용 문정희
	Lecture	특강 Machine Learning	신현정
05월 22일	Lecture	Classification	김주한
	Lecture	Standards and Databasing Expression	김주한
05월 29일	Book reading	4-2 생화학 네트워크의 원리	정희준 장혜련
	Lecture	Gene Ontology and Pathways	김주한
06월 05일	Term Project	Term Project Presentation - I
		Predicting chromosome instability in cancer using gene expression data and location information	김도균
		Importing GEO data into MIAME format-based information System	정 용
		Meta analysis of breast cancer cell line for toxgenomics study	나영지
		Biological process classification in disease related pathway map	정희준
06월 12일	Term Project	Term Project Presentation - II
		갑상선암 데이터베이스 구축	김경원
		시험관 아기시술(IVF) 기록의 DB화	문정희
		약인성 간염 진단 DB 구축	정용진
		Identification of microRNA function by target prediction and expression profiling (DB)	이영애
		OMIM DB를 이용한 피부 유전성 질환 DB의 구축 (DB)	김윤경
		Multicenter database of clinical course of CKD patients	장혜련
		Gene Expression Profile in Proliferation and Apoptosis of Human Hepatic Stellate Cell Using Microarray	신혜원

Administrivia

3학점 강좌입니다. 평가는

● 출석 20%,

● 과제제출 20%,

● Term project proposal 20%,

● Term project presentation 및 Term paper 40% 입니다.

강좌에 출석하시기 전에 미리 Readings를 읽고 오십시오.

시험은 없습니다.

Textbooks, recommended

포스트 지놈 시대의 생물정보학, 미노루 가네히사
Statistical analysis of gene expression microarray data, Terry Speed

History

Bioinformatics for Genomic Medicine 2003

Bioinformatics for Genomic Medicine 2004