Bioinformatics for Genomic Medicine : À¯ÀüüÁ¤º¸ÀÇÇÐ

 

Ã¥ÀÓ±³¼ö: ±èÁÖÇÑ 

°­Àǽð£: ¸ÅÁÖ ¿ù¿äÀÏ ¿ÀÈÄ 2:00 ~ 5:00

°­ÀÇÀå¼Ò: ÀǴ뺻°ü 310È£

°øÁö»çÇ×: B4GM2006 °Ô½ÃÆÇ

Á¶±³: ±èµµ±Õ (8318, davefriend99@gmail.com)

 

Date

Type

Issues

Lecturer

Readings

03¿ù 13ÀÏ

 

Administriva

±èÁÖÇÑ

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Lecture

Introduction

 

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03¿ù 20ÀÏ

Book reading

1 »ý¸íÀÇ Ã»»çÁø

 ±èÀ±°æ ±è°æ¿ø

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Lecture

Internet Resources and Databases

±èÁÖÇÑ

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03¿ù 27ÀÏ

Book reading

2-1 ºÐÀÚ»ý¹°ÇÐ µ¥ÀÌÅͺ£À̽º

 Á¤¿ëÁø ÀÌ¿µ¾Ö

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Lecture

Emerging Genomic Technologies

±èÁÖÇÑ

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04¿ù 03ÀÏ

Book reading

2-2 Á¤º¸°øÇÐ

³ª¿µÁö Á¤¿ë

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Lecture

Database Theory

±èÁÖÇÑ

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04¿ù 10ÀÏ

Book reading

2-3 ºÐÀÚ»ý¹°ÇÐ µ¥ÀÌÅͺ£À̽ºÀÇ »õ·Î¿î ¼¼´ë

Á¤ÈñÁØ ±èÇöÁ¤ 

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Lecture

Normalization / Clustering

±èÁÖÇÑ

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04¿ù 17ÀÏ

Book reading

3-1 À¯»ç¼º °Ë»ö

 ±èµµ±Õ ±èÀ±°æ

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Lecture

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Unsupervised Learning

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04¿ù 24ÀÏ

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Term Project proposal

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Term Project Proposal Presentation

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Gene Expression Profile in Proliferation and Apoptosis of Human Hepatic Stellate Cell Using Microarray ½ÅÇý¿ø
Multicenter database of clinical course of CKD patients ÀåÇý·Ã
OMIM DB¸¦ ÀÌ¿ëÇÑ ÇǺΠÀ¯Àü¼º Áúȯ DBÀÇ ±¸Ãà ±èÀ±°æ
Importing GEO data into MIAME format-based information System Á¤¿ë
Predicting chromosome instability in cancer using gene expression data and location information ±èµµ±Õ
Identification of microRNA function by target prediction and expression profiling ÀÌ¿µ¾Ö
¾àÀμº °£¿° Áø´Ü DB ±¸Ãà Á¤¿ëÁø
Meta-analysis : breast cancer-related pathway study ³ª¿µÁö
Extension of disease-related pathway using text mining Á¤ÈñÁØ
½ÃÇè°ü ¾Æ±â½Ã¼ú(IVF) ±â·ÏÀÇ DBÈ­ ¹®Á¤Èñ
°©»ó¼±¾Ï µ¥ÀÌÅͺ£À̽º ±¸Ãà ±è°æ¿ø
¡¡ ¡¡

05¿ù 01ÀÏ

Book reading

3-2 ±¸Á¶ ¹× ±â´É ¿¹Ãø

Á¤¿ëÁø

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Lecture

Differential Expression

±èÁÖÇÑ

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05¿ù 08ÀÏ

Lecture

Ư°­ Ontology Computing

±èÈ«±â

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Lecture

Mulitple Hypothesis Testing

±èÁÖÇÑ

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05¿ù 15ÀÏ

Book reading

4-1 ³×Æ®¿öÅ© Ç¥Çö°ú ¿¬»ê

Á¤¿ë ¹®Á¤Èñ 

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Lecture

Ư°­ Machine Learning

½ÅÇöÁ¤

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05¿ù 22ÀÏ

Lecture

Classification

±èÁÖÇÑ

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Lecture

Standards and Databasing Expression

±èÁÖÇÑ

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05¿ù 29ÀÏ

Book reading

4-2 »ýÈ­ÇÐ ³×Æ®¿öÅ©ÀÇ ¿ø¸®

 Á¤ÈñÁØ ÀåÇý·Ã

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Lecture

Gene Ontology and Pathways

±èÁÖÇÑ

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06¿ù 05ÀÏ

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Term Project

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Term Project Presentation - I

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Predicting chromosome instability in cancer using gene expression data and location information ±èµµ±Õ

Importing GEO data into MIAME format-based information System Á¤ ¿ë
Meta analysis of breast cancer cell line for toxgenomics study ³ª¿µÁö
Biological process classification in disease related pathway map

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Á¤ÈñÁØ

06¿ù 12ÀÏ

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Term Project

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Term Project Presentation - II

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°©»ó¼±¾Ï µ¥ÀÌÅͺ£À̽º ±¸Ãà ±è°æ¿ø
½ÃÇè°ü ¾Æ±â½Ã¼ú(IVF) ±â·ÏÀÇ DBÈ­ ¹®Á¤Èñ
¾àÀμº °£¿° Áø´Ü DB ±¸Ãà Á¤¿ëÁø
Identification of microRNA function by target prediction and expression profiling     (DB) ÀÌ¿µ¾Ö
OMIM DB¸¦ ÀÌ¿ëÇÑ ÇǺΠÀ¯Àü¼º Áúȯ DBÀÇ ±¸Ãà                                  (DB) ±èÀ±°æ
Multicenter database of clinical course of CKD patients ÀåÇý·Ã
Gene Expression Profile in Proliferation and Apoptosis of Human Hepatic Stellate Cell Using Microarray ½ÅÇý¿ø

Administrivia

3ÇÐÁ¡ °­ÁÂÀÔ´Ï´Ù. Æò°¡´Â 

¡Ü Ãâ¼® 20%, 

¡Ü °úÁ¦Á¦Ãâ 20%, 

¡Ü Term project proposal 20%, 

¡Ü Term project presentation ¹× Term paper 40% ÀÔ´Ï´Ù.

°­Á¿¡ Ãâ¼®ÇϽñâ Àü¿¡ ¹Ì¸® Readings¸¦ ÀÐ°í ¿À½Ê½Ã¿À.

½ÃÇèÀº ¾ø½À´Ï´Ù.

Textbooks, recommended

Æ÷½ºÆ® Áö³ð ½Ã´ëÀÇ »ý¹°Á¤º¸ÇÐ, ¹Ì³ë·ç °¡³×È÷»ç
Statistical analysis of gene expression microarray data, Terry Speed

History

Bioinformatics for Genomic Medicine 2003

Bioinformatics for Genomic Medicine 2004