유전체 정보분석 전문가 기본과정 II

Bioinformatics와 NGS 기술의 급격한 발전으로 인간 유전체 데이터에 기반한 개인 맞춤의학의 시대가 성큼
다가왔습니다. 임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 바이오-정보-의학적 도구 사용의
중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다.
서울대학교병원 정밀의료 전문인력 양성과정에서는 급변하는 연구 환경에 대응하고, 유전체 데이터 기반의
맞춤의료 시대를 선도하는 유전체 임상 정보분석 전문가 양성을 위하여, 공개 소프트웨어인 R 통계
package와 Python 프로그래밍, 리눅스 환경 실습 및 유전체 자료분석으로 구성된 매주 토요일 총 12주
간의 유전체 정보분석 전문가 기본과정II 수강생을 모집하오니 많은 지원을 바랍니다.


일시 및 장소

일 시 : 202257() ~ 2022723()                    

장 소 : 도와세움평생교육센터(포헤라운지) 304호 (서울시 성동구 고산자로 253)
   감염병 상황에 따라 교육장소 변경 혹은 온라인 수업 전환
주 최 : 한국보건복지인력개발원
주 관 : 서울대학교병원, 서울의대 정보의학실
인 원 : 35명 내외
등록비 : 무료

일정별 프로그램

시간

5/7 (토) 5/14 (토) 5/21 (토) 5/28 (토) 6/4 (토)

주제

R 통계학 R 통계학
R 통계학
파이썬
파이썬

9:00~
10:35

Starting with R
Microarray data analysis I
Reshaping data
and Cluster
Starting with Python
Medical informatics practice 1

10:45~
12:15

Data manipulation
with R
Microarray Data Analysis
II
Evaluation and Validation
Data structure of python
Medical informatics practice
2

12:15~
13:15

중  식 

주제

R 통계학 R 통계학
R 통계학
파이썬
파이썬

13:15~
14:50

Statistical Analysis
I
Classification using
R
Cell line Data at
GDSC & CCLE
Functions of Python
Defining Class

15:00~
16:35

Statistical Analysis
II
Advanced pathway analysis
Survival analysis
Regular expression
Python machine learning

16:45~
18:15

Advanced R graphics
and ggplot2
Exploratory Data Analysis
Case study
Bioinformatics Practice
Python visualization

시간

6/11 (토) 6/18 (토) 6/25 (토) 7/2 (토) 7/9 (토)

주제

리눅스
프로그래밍
리눅스
프로그래밍
NGS 자료처리
NGS 자료처리
엑솜 및 전장
유전체

9:00~
10:35

Linux file system
Linux Permission
Germline Analysis Pipeline
PreProcessing
Germline calling

10:45~
12:15

Editing with VI
Linux Internet,
Network
Genome assembly practice
I
CellQC
with R
Germline filtering/ Annotation

12:15~
13:15

중  식 

주제

리눅스
프로그래밍
리눅스
프로그래밍
NGS 자료처리
NGS 자료처리
엑솜 및 전장
유전체

13:15~
14:50

Linux Shell
Programming
Linux Server
Genome assembly practice
II
PostProcessing1
Somatic calling

15:00~
16:35

Linux Operation
Linux Multitasking and Cluster
Genome annotation practice
PostProcessing2
Somatic Filtering/ Annotation

16:45~
18:15

Advanced Programming
Linux LVM
Evolution analysis practice
Interpretation
CNV

시간

7/16 (토) 7/23 (토)

주제

엑솜 및 전장
유전체
전사체
후성유전체



9:00~
10:35

Cancer Genome Analysis
Non-coding RNA Analysis



10:45~
12:15

Somatic Variant Detection
Gene Fusion Analysis
RNA-Seq Gene Expression
Analysis



12:15~
13:15

중  식 

주제

엑솜 및 전장
유전체
전사체
후성유전체



13:15~
14:50

Advanced Cancer Genome
Data Analysis
Sequence-level
Transcriptome Analysis



15:00~
16:35

Somatic CNV detection
Epigenome Data Analysis



16:45~
18:15

Multiomics and
Precision Medicine
Epigenome Tools & Databases
Visualization of DNA Methylation Data




  • 교육대상:

    (1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
    (2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
    (3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자

  • 지원절차:

    서류 전형 및 합격자 개별 통지
    원서교부 및 접수기간 : 2022.4.14 ~ 2022.4.28
    제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
    사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
    홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course10.html
    지원방법 : 이메일 제출(우편 접수 불가)
    합격자 발표일시 : 2022.5.2 (예정)

  • 지원서 다운로드(한글)
    지원서 다운로드(워드)

    실습 컴퓨터

    강의실에 개인 컴퓨터가 없으므로, 실습 시 개인노트북 반드시 지참 (CPU i5 이상, RAM 16GB 이상 권장)
    Apple M1칩 노트북의 경우, 프로그램 호환성 문제로 일부 실습 프로그램은 지원이 안될 수 있습니다.

    장 소 : 도와세움평생교육센터(포헤라운지) 304호 (서울시 성동구 고산자로 253)
    교 통 : 2호선 왕십리역 2번 출구에서 100m
       5호선 왕십리역 4번 출구에서 340m
    주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.