À¯ÀüÀÚ¹ßÇö ¿¬±¸¸¦ À§ÇÑ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ

ºÐÀÚ»ý¹°ÇÐÀûÀÎ ±â¼ú°ú ·Îº¿°øÇÐÀÇ ¹ß´Þ·Î ÀÎÇØ À¯ÀüÀÚ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ ±â¼úÀÌ µîÀåÇÏ°Ô µÇ¾ú´Ù. À¯ÀüÀÚ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ´Â ÇÑ »ý¹°Ã¼ÀÇ À¯ÀüÀÚ Àüü ¶Ç´Â ÀϺο¡ ´ëÇØ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö¾çÀ» ÃøÁ¤ÇÒ ¼ö ÀÖ´Â µµ±¸ÀÌ´Ù. ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌÀÇ µµÀÔÀº ¼¼Æ÷³» À¯ÀüÀÚ °üÂû ´É·ÂÀ» °ú°Å °³°³ À¯ÀüÀÚ ¼öÁØ¿¡¼­ Àüü·Î È®ÀåÇÏ¿´°í, »ý¸íü¸¦ ÇϳªÀÇ ½Ã½ºÅÛÀ¸·Î ¿¬±¸ÇÏ°Ô ÇÏ¿´´Ù. ¶ÇÇÑ ±âÁ¸ÀÇ À¯ÀüÀÚ °ËÃâ ±â¹ýÀ» º´·ÄÈ­Çؼ­ ´ë±Ô¸ð·Î ¼öÇàÇÏ´Â °ÍÀ̹ǷΠµ¥ÀÌÅ͸¦ ó¸®ÇÏ°í ºÐ¼®ÇÏ´Â ¹æ½Ä¿¡µµ ȹ±âÀûÀÎ º¯È­¸¦ °¡Á®¿Ô´Ù.

À¯ÀüÀÚ ¹ßÇöÀ» ÃøÁ¤Çϱâ À§ÇÑ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ ½ÇÇèÀº Å©°Ô 5´Ü°è·Î ³ª´­ ¼ö ÀÖ´Ù.
1 ´Ü°è´Â À¯ÀüÀÚ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹À̸¦ Á¦ÀÛÇÏ´Â ´Ü°èÀÌ´Ù. À¯ÀüÀÚ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ´Â ½½¶óÀ̵å 1§² Á¤µµÀÇ Ç¥¸é¿¡ ¼öõ¿¡¼­ ¼ö¸¸ Á¾·ùÀÇ À¯ÀüÀÚ ¼­¿­À» °íÁ¤ÇÑ °ÍÀÌ´Ù.
2 ´Ü°è´Â ´Ù¾çÇÑ ½ÇÇè Á¶°Ç¿¡¼­ äÃëÇÑ ¼¼Æ÷ÀÇ RNA¸¦ ÃßÃâÇÏ°í Çü±¤¹°Áú·Î Ç¥ÁöÇÏ´Â ´Ü°èÀÌ´Ù.
3 ´Ü°è´Â Ç¥ÁöµÈ RNA¸¦ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ¿Í È¥ÇÕÇÏ´Â °úÁ¤ÀÌ´Ù (hybridization). RNA´Â ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ À§ÀÇ À¯ÀüÀÚ¿Í »óº¸ÀûÀÎ °áÇÕÀ» ÇÏ°Ô µÈ´Ù.
4 ´Ü°è´Â RNA¿Í ¹ÝÀÀÇÑ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹À̸¦ ½ºÄ³´× ÇÏ¿© À̹ÌÁö·Î Çü»óÈ­ÇÑ ÈÄ À̹ÌÁö ºÐ¼®ÇÁ·Î±×·¥À¸·Î À¯ÀüÀÚ À§Ä¡¸¶´Ù Çü±¤¹°Áú¿¡ µû¸¥ ¹ß»ö°­µµ¸¦ ÃøÁ¤ÇÏ´Â °úÁ¤ÀÌ´Ù. À¯ÀüÀÚÀÇ Çü±¤ °­µµ´Â ±× À¯ÀüÀÚÀÇ ¹ßÇöÁ¤µµ¸¦ ¾Ë·ÁÁÖ´Â °ÍÀÌ´Ù.
5 ´Ü°è´Â Á¤·®È­µÈ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö ¼öÄ¡ µ¥ÀÌÅ͸¦ ¼öÇÐ, Åë°è ±×¸®°í ÄÄÇ»ÅÍ °øÇаú °°Àº Á¤º¸ÇÐÀ» ÀÌ¿ëÇÏ¿© ºÐ¼®ÇÏ´Â ´Ü°èÀÌ´Ù.



figure from Nat. Genet. 21:10-14 (1999)

Àΰ£ À¯Àüü »ç¾÷ (Human Genome Project)ÀÌ ÁøÇàµÇ¸é¼­ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ ±â¼úÀ» ÀÌ¿ëÇÑ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö ¿¬±¸´Â ±Þ¼ÓÈ÷ È®ÀåÇÏ°í ÀÖ´Ù. À¯ÀüÀÚ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ ±â¼úÀº »ý¸í°úÇÐ ºÐ¾ßÀÇ ±âÃÊ¿¬±¸´Â ¹°·Ð Áúº´ÀÇ Áø´Ü°ú ¿¹Ãø, ½Å¾à°³¹ß µî ÀÇ¾à ºÐ¾ß¿¡µµ ³Î¸® ÀÀ¿ëµÇ°í ÀÖ´Ù.

 

 À¯ÀüÀÚ¹ßÇö µ¥ÀÌÅÍÀÇ ±¸Á¶¿Í ÇüÅÂ

À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö µ¥ÀÌÅ͸¦ Çؼ®Çϱâ À§Çؼ­ ÇÊ¿äÇÑ Á¤º¸¸¦ ¼¼ °¡Áö·Î Á¤¸®ÇÒ ¼ö ÀÖ´Ù.

ù ¹ø°´Â ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ À§¿¡ À§Ä¡ÇØ ÀÖ´Â À¯ÀüÀÚ¿¡ °üÇÑ ÁÖ¼®Á¤º¸ÀÌ´Ù (genes). À¯ÀüÀÚ À̸§, ¼­¿­, ±â´É µî¿¡ °üÇÑ ¼³¸íÀ¸·Î À¯ÀüÀÚ ¼­¿­ µ¥ÀÌÅͺ£À̽º µî ¿ÜºÎ ÀÚ¿ø°ú ¿¬°áÇÏ¿©¾ß ÇÑ´Ù.

µÎ ¹ø°´Â »ý¹°ÇÐÀû ½Ã·á¿Í ½Ã·á°¡ ¾ò¾îÁø ½ÇÇè Á¶°Ç¿¡ ´ëÇÑ »ó¼¼ÇÑ ÁÖ¼®ÀÌ´Ù (samples). »ý¹°ÇÐÀû ½Ã·á¿Í ½ÇÇèÁ¶°ÇÀº ´Ù¾çÇϱ⠶§¹®¿¡ ÁÖ¼® ¹æ½ÄÀÇ ±¸Á¶¸¦ Á¤ÇϱⰡ ¾î·Æ´Ù. Ç¥ÁØÈ­µÈ ¿ë¾î¸¦ ÀÌ¿ëÇÏ¿© Àǹ̸¦ Á¤È®ÇÏ°í ÅëÀϼº ÀÖ°Ô ±â¼úÇÏ´Â °ÍÀÌ Áß¿äÇÏ´Ù.

¼¼ ¹ø° À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö ¸ÅÆ®¸¯½º (gene expression matrix)´Â ƯÁ¤ ½ÇÇèÁ¶°Ç¿¡¼­ À¯ÀüÀÚµéÀÇ ¹ßÇö Á¤º¸¸¦ ´ã°í ÀÖ´Ù. Á¤·®È­µÈ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇöÁ¤µµ´Â ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ À§ÀÇ À¯ÀüÀÚ¿Í »ý¹°ÇÐÀû ½Ã·á¸¦ ¾çÂÊ ÃàÀ¸·Î ÇÏ´Â 2Â÷¿ø ¸ÅÆ®¸¯½º¸¦ ±¸¼ºÇÑ´Ù.


figure from Nat. Genet. 29:365-71 (2001)

 

 À¯ÀüÀÚ¹ßÇö µ¥ÀÌÅͺ£À̽º

´Ù¾çÇÏ°í º¹ÀâÇÑ ±¸Á¶ÀÇ ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ µ¥ÀÌÅ͸¦ È¿°úÀûÀ¸·Î Á¢±ÙÇÏ°í ó¸®ÇÒ ¼ö ÀÖ±â À§Çؼ­´Â µ¥ÀÌÅͺ£À̽º °³¹ßÀÌ ÇʼöÀûÀÌ´Ù.
°³¹ß ¸ñÀû¿¡ µû¶ó Å©°Ô °ø¿ë µ¥ÀÌÅͺ£À̽º¿Í ·ÎÄà µ¥ÀÌÅͺ£À̽º·Î ºÐ·ùÇÒ ¼ö ÀÖ´Ù. °ø¿ë µ¥ÀÌÅͺ£À̽º´Â ¿Ï°áµÈ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö µ¥ÀÌÅ͸¦ ±³È¯ÇÏ°í °ø°³µÈ µ¥ÀÌÅ͵éÀ» ¸ð¾Æ ¸ÞŸ ºÐ¼®Çϱâ À§ÇØ »ç¿ëµÈ´Ù. ·ÎÄà µ¥ÀÌÅͺ£À̽º ¸ðµç À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö µ¥ÀÌÅÍ (À̹ÌÁö µî)¸¦ ÀúÀåÇÏ°í ºÐ¼®À» ¿ëÀÌÇÏ°Ô ÇÏ¸ç ¾î·¹ÀÌ, ½Ã¾à ¹× ½ÇÇè Àåºñ µîÀ» ÃßÀûÇÏ°í °ü¸®Çϱâ À§ÇØ ÇÊ¿äÇÏ´Ù.


Imformation storage and transfer of data for a microarray experiment
figure from Nat. Genet. 32:469-473 (2002)

´ëÇ¥ÀûÀÎ °ø¿ë µ¥ÀÌÅͺ£À̽º·Î´Â EBI (Europe Bioinformatics Institute)ÀÇ ArrayExpress, NCBI (National Center for Biotechnology Information)ÀÇ GEO (Gene Expression Omnibus), Stanford ´ëÇÐÀÇ SMD (Stanford Microarray Database) µîÀÌ ÀÖ´Ù.

¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹ÀÌ µ¥ÀÌÅÍ´Â ºÐ¼®ÇÏ°í Çؼ®ÇÏ´Â ¹æ½ÄÀÌ ´Ù¾çÇϱ⠶§¹®¿¡ ¿¬±¸ÀÚ°£¿¡ µ¥ÀÌÅÍ ±³È¯ÀÌ ¿øÈ°ÇØ¾ß ÇÑ´Ù. ±×·¯³ª µ¥ÀÌÅͺ£À̽º¸¶´Ù µ¥ÀÌÅ͸¦ ÀúÀåÇÏ´Â Çü½Ä°ú ±¸Á¶°¡ ´Ù¸£±â ¶§¹®¿¡ µ¥ÀÌÅ͸¦ °øÀ¯Çϱâ À§ÇÑ °øÅë±â¹ÝÀÌ ÇÊ¿äÇÏ´Ù. µ¥ÀÌÅͺ£À̽º¿¡ Ư¼öÇÏ°Ô ÀúÀåµÈ µ¥ÀÌÅÍÀÏÁö¶óµµ Ç¥ÁØ Çü½ÄÀ¸·Î Àü´ÞµÇ¸é ¾î´À °÷¿¡¼­µçÁö ÀÚÀ¯·Ó°Ô ÀÀ¿ëµÉ ¼ö Àֱ⠶§¹®ÀÌ´Ù. ÀÌ·¯ÇÑ ÇÊ¿ä¿¡ µû¶ó ÃÖ±Ù ¹ßÇ¥µÇ°í ÀÖ´Â µ¥ÀÌÅͺ£À̽º´Â °ø½ÄÀûÀ¸·Î ÀÎÁ¤¹Þ°í ÀÖ´Â MGED Ç¥ÁØÀ» Áö¿øÇÏ°í ÀÖ´Â Ãß¼¼ÀÌ°í, ¸¹Àº µ¥ÀÌÅͺ£À̽º°¡ ÀÌ Ç¥ÁؾÈÀ» ¹Þ¾ÆµéÀÏ °ÍÀ¸·Î ¿¹»óµÈ´Ù.


Relationships among the different MGED initiatives
figure from Nat. Genet. 32:469-473 (2002)

 Databases

 

 Âü°í¹®Çå

- ±èÁÖÇÑ. »ý¸íÁ¤º¸Çаú À¯ÀüüÀÇÇÐ (Á¾¼³). ¿¹¹æÀÇÇÐȸÁö. 35:83-91 (2002)
- Duggan DJ. et al. Expression profiling using cDNA microarrays. Nat. Genet. 21:10-14 (1999)
- Young RA. Biomedical discovery with DNA arrays. Cell 102:9-15 (2000)
- Brazma A. et al. Minimum information about a microarray experiment (MIAME)-toward standards for microarray data.
    Nat. Genet. 29:365-71 (2001)
- Stoeckert CJ Jr. et al. Microarray databases: standards and ontologies. Nat. Genet. 32:469-473 (2002)

 

back to main page