Supplementary Table 6.
Microarray results of 1,355 injury-specific genes and 392 recovery-specific gene identified by 2-way ANOVA a.
Spot ID	Gene	GenBank	UniGene	ANOVA b	Class c	V_6h vs NT	V_24h vs NT	V_72h vs NT	L_6h vs NT	L_24h vs NT	L_72h vs NT	H_6h vs NT	H_24h vs NT	H_72h vs NT	Regulation d
581260	M6prbp1	NM_025836	Mm.311696	MxBx	613	-0.46	-0.01	-0.51	-1.07	0.02	-0.47	-0.79	-0.02	-0.69	id
456144		NA		MABI	102	-0.37	0.47	0.20	-1.23	0.17	-0.06	0.25	0.30	-0.69	id
392163	2810453K03Rik	NM_144517	Mm.28823	MxBI	205	-0.16	0.17	-0.69	-0.85	0.34	-0.30	0.24	-0.14	-0.69	id
408929	Mocos	AK076385	Mm.28252	MxBx	912	-0.66	-0.29	-0.65	-1.05	-0.31	-0.47	-0.62	-0.54	-0.68	id
870999	Pdhb	NM_024221	Mm.301527	MxBx	710	-0.60	0.20	-0.58	-0.87	0.12	-0.54	-0.95	-0.55	-0.68	id
733769	Rhoe	NM_028810	Mm.46497	MxxI	401	-0.08	-0.32	-0.40	-0.84	-0.77	-0.33	-0.30	-0.05	-0.67	id
403223	9030625G08Rik	AK037372	Mm.32314	MxBx	504	-0.15	-0.30	-0.37	0.26	-1.00	-0.23	0.38	-0.66	-0.67	id
329285	2700075B01Rik	NM_029669	Mm.354767	MxBx	513	0.01	0.07	-0.61	-0.79	0.06	-0.26	-0.98	-0.18	-0.67	id
915002	Rfxank	NM_011266	Mm.161167	MxBx	1311	-0.61	-0.36	-0.05	-0.87	-0.11	-0.23	-0.89	-0.40	-0.67	id
327909	Adamts18	AK036137	Mm.167471	MxxI	401	-0.66	-0.54	-0.63	-0.74	-0.80	0.37	-0.75	0.54	-0.65	id
378072	2010208K18Rik	NM_028095	Mm.28631	MxBI	105	-0.47	-0.32	-0.62	-1.14	0.02	-0.32	0.02	-0.04	-0.64	id
400247	G22p1	NM_010247	Mm.288809	MxBI	105	-0.25	-0.24	-0.52	-0.79	-0.20	-0.35	-0.52	0.17	-0.64	id
507997	BC057079	BC057079	Mm.287210	MxBx	313	-0.35	-0.01	-0.49	-0.91	-0.25	-0.52	-0.25	0.04	-0.63	id
447598	1500032H18Rik	BC019519	Mm.63984	MxBx	513	-0.60	0.08	-0.24	-0.82	-0.12	-0.57	-0.40	0.47	-0.63	id
755631	C330027I04Rik	NM_026561	Mm.28738	MxBx	513	0.02	-0.13	-0.67	-0.98	0.19	-0.52	-0.39	0.39	-0.62	id
926144	Apip	NM_019735	Mm.24772	MxBx	913	-0.67	-0.32	-0.67	-0.88	-0.36	-0.45	-0.77	-0.44	-0.62	id
899821	Hmgn2	NM_016957	Mm.319660	MxBx	513	-0.19	-0.31	-0.60	-1.12	-0.16	-0.39	-0.54	0.44	-0.61	id
908786	Eaf2	NM_134111	Mm.386836	MxBx	910	-0.61	-0.07	-0.21	-1.33	-0.34	-0.04	-1.62	-0.30	-0.61	id
682363	Itm1	NM_008408	Mm.2863	MABx	404	-0.36	-0.21	-0.53	-0.78	-0.26	-0.64	-0.24	0.51	-0.61	id
476954	Uros	NM_009479	Mm.3160	MxBI	105	-0.16	0.07	-0.23	-1.10	0.07	-0.33	-0.27	-0.12	-0.60	id
606928	2510027N19Rik	NM_026330	Mm.4467	MxBx	610	-0.69	-0.25	-0.62	-0.96	-0.06	-0.66	-0.66	-0.08	-0.60	id
360521	1810011E08Rik	AK048051	Mm.86437	MABI	102	-0.39	-0.23	-0.42	-0.82	-0.39	-0.48	-0.04	0.63	-0.60	id
535120	Ppp1r14c	AK047227	Mm.308126	MxBI	105	-0.52	-0.03	-0.51	-1.01	0.06	-0.15	-0.82	0.40	-0.60	id
682325	Pwp2h	NM_029546	Mm.103522	MxBx	605	0.04	-0.14	-0.21	0.50	-0.77	-0.33	-0.26	-0.48	-0.60	id
831790	Ralgps2	NM_023884	Mm.28376	MxBI	104	-0.52	-0.11	-0.25	-1.26	-0.26	0.02	-0.62	-0.03	-0.59	id
456571	Trip3	AK014350	Mm.379733	MxxI	402	-0.16	-0.46	-0.56	-0.86	-0.41	-0.36	-0.39	0.02	-0.59	id
860185	Elp4	NM_023876	Mm.33870	MxBx	413	-0.67	-0.20	-0.34	-0.73	0.00	-0.45	-0.52	-0.03	-0.59	id
551096	Cds2	NM_138651	Mm.284503	MABI	102	-0.66	-0.47	-0.49	-1.91	-0.15	-0.59	-0.91	0.36	-0.59	id
453130	E130115J16Rik	AK081218	Mm.211198	MxBx	813	-0.41	0.32	0.02	-0.91	0.06	-0.13	-0.82	-0.17	-0.58	id
922635	Vdac1	NM_011694	Mm.3555	MxBx	813	-0.61	-0.17	-0.36	-1.06	-0.02	-0.16	-0.63	0.20	-0.58	id
308247	AW061290	NM_201361	Mm.293063	MxBx	1313	-0.68	-0.10	-0.69	-0.95	-0.22	-0.38	-1.00	-0.71	-0.57	id
336961		NA		MxBx	613	-0.35	0.13	-0.52	-0.97	0.52	-0.38	-0.06	0.57	-0.57	id
680229	Ntan1	NM_010946	Mm.370194	MAxx	104	-0.11	-0.25	-0.07	-0.82	-0.44	-0.45	-0.30	-0.39	-0.57	id
928204	Hs1bp3	NM_021429	Mm.309954	MABI	102	-0.33	-0.10	-0.16	-1.46	-0.43	-0.34	-0.62	0.02	-0.57	id
391496	2410018G20Rik	NM_029354	Mm.22351	MxBI	103	-0.54	-0.26	-0.44	-0.92	-0.07	-0.07	-0.79	-0.08	-0.57	id
844848	2310020P08Rik	NM_027134	Mm.287956	MxBx	513	-0.34	0.64	-0.21	-0.77	0.45	-0.66	-0.29	0.35	-0.56	id
478641	Dgkg	AK085357	Mm.379296	MxBx	513	-0.20	0.49	-0.18	-0.73	0.06	-0.17	-0.58	0.46	-0.56	id
783757	1110001K21Rik	NM_025839	Mm.325564	MxBx	713	-0.69	0.20	-0.34	-1.02	0.00	-0.36	-0.01	0.40	-0.56	id
743725	Map2k5	NM_011840	Mm.325746	MxBx	1013	-0.54	-0.29	-0.08	-1.09	-0.55	-0.30	-0.83	-0.40	-0.55	id
491495	4933440H19Rik	BC057613	Mm.102341	MxBx	405	0.34	0.19	-0.65	0.29	-0.97	-0.57	0.59	-0.37	-0.54	id
898923	Gemin6	NM_026053	Mm.279985	MxBx	513	-0.07	-0.12	-0.41	-0.75	-0.29	-0.35	-0.45	0.21	-0.54	id
905986	Mrps28	NM_025434	Mm.38460	MxBx	613	-0.69	0.04	-0.65	-0.87	-0.27	-0.57	-0.82	0.04	-0.54	id
665139	Eif3s2	NM_018799	Mm.250874	MxBx	610	-0.38	-0.27	-0.30	-0.93	0.09	-0.39	-0.46	0.29	-0.54	id
825725	Tctex1	NM_009342	Mm.1948	MxBx	513	-0.45	0.06	-0.39	-0.95	0.09	-0.38	-0.37	0.42	-0.54	id
708058	Ttc5	NM_177625	Mm.276362	MxBx	613	-0.40	-0.23	-0.22	-0.93	-0.15	-0.59	-0.83	0.15	-0.54	id
773304	Ccnj	NM_172839	Mm.309	MxBx	701	0.44	-0.34	0.20	0.11	-0.88	-0.55	0.40	0.15	-0.52	id
562429		AK087591		MxBx	504	0.45	0.09	-0.13	0.28	-1.05	-0.52	0.68	-0.11	-0.52	id
462646		NA		MxBI	105	-0.55	-0.24	-0.19	-1.04	0.31	0.06	-0.12	0.27	-0.52	id
319207		NA		MxBx	701	-0.28	-0.42	-0.58	0.54	-0.89	-0.47	0.23	-1.51	-0.51	id
737168	Ap1g2	NM_007455	Mm.238879	MABx	102	-0.65	0.00	-0.59	-1.04	-0.07	-0.50	-1.46	-0.90	-0.51	id
789533	Atp6v1g1	NM_024173	Mm.371615	MxBI	105	-0.25	-0.27	-0.38	-0.79	-0.22	-0.17	-0.83	0.04	-0.51	id
798481	Stam2	NM_019667	Mm.263639	MxBx	710	-0.51	0.10	-0.25	-0.79	-0.03	-0.45	-0.54	-0.11	-0.51	id
895170		NM_007660		MxBx	813	-0.69	-0.16	-0.23	-0.79	-0.33	-0.18	-0.49	0.11	-0.51	id
691253	Mtap4	NM_008633	Mm.217318	MxBx	611	-0.50	-0.17	-0.65	-0.91	-0.28	-0.51	-0.62	-0.30	-0.51	id
780034	4933434E20Rik	NM_025762	Mm.300083	MxBI	502	-0.08	-0.14	0.16	0.41	-1.51	-0.03	0.44	-0.42	-0.51	id
897893	Psme2	NM_011190	Mm.371573	MxBx	713	-0.52	-0.24	-0.46	-0.96	-0.42	-0.41	-0.62	0.11	-0.50	id
626171	Pecr	AK081161	Mm.281738	MABx	401	0.08	0.00	0.14	-0.21	-1.19	-0.41	-0.28	-0.82	-0.50	id
752232	Cox8a	NM_007750	Mm.14022	MxBx	713	-0.35	-0.22	-0.27	-0.71	0.04	-0.10	-0.23	-0.07	-0.49	id
893811		NA		MxxI	404	-0.05	-0.67	-0.57	-0.45	-0.96	-0.61	-0.86	-0.02	-0.49	id
598968	Wdr1	NM_011715	Mm.2654	MxBx	513	-0.25	-0.20	-0.53	-0.77	-0.14	-0.40	-0.51	0.40	-0.49	id
924435	Ldh2	NM_008492	Mm.9745	MABx	101	-0.35	-0.38	-0.04	-1.00	-0.16	-0.43	-1.00	-0.75	-0.48	id
893834		NA		MxBx	912	-0.62	-0.19	-0.36	-1.07	-0.26	-0.25	-1.07	0.02	-0.48	id
771133		AK040430	Mm.101501	MxBx	413	-0.59	0.40	-0.28	-0.94	-0.35	-0.37	-0.44	0.46	-0.48	id
698736	Crbn	NM_175357	Mm.290085	MxBx	1009	-0.65	-0.31	-0.06	-0.92	-0.22	0.15	-0.46	-0.19	-0.47	id
878953	2410022L05Rik	NM_025556	Mm.29063	MxBx	1310	-0.64	0.35	-0.13	-0.76	0.39	-0.14	-0.94	0.19	-0.47	id
642958	Scly	NM_016717	Mm.25724	MxBx	1112	-0.53	-0.05	-0.20	-0.87	-0.30	-0.18	-0.64	-0.30	-0.47	id
590482	Arfgef2	AK084239	Mm.297192	MxBx	713	-0.40	-0.31	-0.47	-0.79	-0.21	-0.22	-0.67	-0.12	-0.47	id
552612	Pdha1	NM_008810	Mm.34775	MxBx	812	-0.59	-0.10	-0.35	-0.89	-0.01	-0.10	-0.81	0.23	-0.47	id
362464	Ubl4	NM_145405	Mm.3979	MxBx	813	-0.55	-0.17	-0.15	-0.93	-0.17	-0.43	-0.61	0.22	-0.46	id
664457	Blvra	NM_026678	Mm.22028	MxBx	613	-0.29	0.12	-0.30	-0.81	0.08	-0.14	-0.62	0.19	-0.45	id
912752	Oma1	NM_025909	Mm.30021	MxBx	913	-0.53	-0.27	-0.44	-0.78	-0.22	-0.31	-0.73	-0.26	-0.44	id
354187	Exoc7	NM_016857	Mm.22530	MxBI	104	-0.45	-0.19	-0.42	-0.86	-0.16	-0.24	-0.75	0.10	-0.44	id
911668	425O18-1	NM_019421	Mm.11175	MxxI	401	-0.37	-0.58	-0.03	-0.99	-0.03	0.12	-0.65	-0.05	-0.43	id
772294	Pir	AK009757	Mm.293463	MxBx	613	0.12	0.23	-0.65	-0.99	0.27	-0.32	-0.85	-0.10	-0.43	id
367142		NM_172304		MxxI	401	-0.26	-0.23	-0.10	-0.79	-0.05	-0.15	-0.10	0.11	-0.43	id
650597	P2rx4	NM_011026	Mm.290884	MxBI	105	-0.45	-0.27	-0.32	-0.79	-0.23	-0.16	-1.09	0.51	-0.43	id
757052		NA		MxBx	1013	-0.54	-0.07	-0.31	-0.92	-0.36	-0.14	-1.20	-0.23	-0.42	id
734920	1200004M23Rik	NM_026169	Mm.202092	MxBx	711	-0.34	0.17	-0.61	-1.25	0.57	-0.42	-0.83	0.05	-0.42	id
643952	2810428C21Rik	NM_153503	Mm.307182	MABx	404	0.19	0.12	-0.58	-0.73	-0.04	-0.67	-0.14	0.19	-0.42	id
801530	Tubb6	AK041002	Mm.181860	MABx	101	-0.55	0.07	0.03	-0.81	-0.44	-0.12	-1.01	-0.71	-0.41	id
821740	AI842396	NM_213729	Mm.101581	MxBx	1311	-0.50	-0.19	-0.24	-0.85	-0.17	0.11	-0.34	-0.07	-0.41	id
571559	Sdhc	NM_025321	Mm.198138	MxBx	1311	-0.69	-0.18	-0.24	-0.94	-0.19	-0.26	-0.77	-0.51	-0.41	id
391883	Ddef1	NM_010026	Mm.277236	MxBI	102	-0.15	-0.21	-0.46	-0.74	-0.08	-0.37	-1.14	-0.56	-0.41	id
900157	Hmgb3	NM_008253	Mm.336087	MxBx	1110	-0.44	-0.61	-0.37	-1.37	-0.35	-0.16	-0.93	-0.38	-0.41	id
909403	Cpsf3	NM_018813	Mm.356778	MxBx	513	-0.40	-0.18	-0.64	-0.78	-0.20	-0.60	-0.63	-0.14	-0.41	id
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399160	9530002K18Rik	NM_183123	Mm.99224	MAxx	101	-0.12	0.14	0.23	0.12	-0.09	0.01	0.72	0.91	0.14	iu
838322	AW548124	BC022157	Mm.311974	MxBx	104	0.58	0.03	-0.21	0.49	-0.21	0.15	0.72	0.09	-0.28	iu
761206	Itih3	NM_008407	Mm.4517	MABx	404	0.55	-0.20	0.10	0.40	-0.22	-0.34	0.72	1.00	0.41	iu
478402		AJ007296	Mm.333012	MAxI	102	-0.38	0.29	0.10	-0.43	0.09	-0.67	0.72	0.29	-0.01	iu
572196	Sec23ip	AK048053	Mm.297105	MxBx	101	0.65	-0.01	0.19	0.62	0.28	-0.12	0.72	0.17	-0.01	iu
733486	8430415E04Rik	NM_028980	Mm.248619	MxBx	106	0.34	-0.03	-0.32	0.53	0.49	-0.08	0.73	0.65	0.03	iu
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303177	Sec15l2	BC043037	Mm.159621	MAxx	104	0.30	0.53	0.22	-0.57	-0.42	-0.35	1.00	0.10	0.08	iu
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814728	4930485D02Rik	NM_175225	Mm.293449	MxBx	103	0.47	0.29	0.08	0.62	-0.27	-0.35	1.02	0.32	-0.69	iu
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405688		AK080076	Mm.355244	MxBx	803	0.22	0.25	0.65	0.42	0.04	0.28	1.07	0.02	0.68	iu
367615	Pnpt1	AK085482	Mm.211131	MxBx	203	0.39	0.01	-0.31	0.29	-0.33	-0.11	1.08	-0.06	-0.14	iu
903778	Ubb	NM_011664	Mm.371592	MxBx	101	0.40	0.07	0.46	0.65	0.31	0.35	1.09	0.38	0.25	iu
852613	Ccl3	X12531	Mm.1282	MxBx	604	0.20	0.08	-0.21	0.58	-0.05	-0.09	1.10	0.18	0.15	iu
747173	0610037D15Rik	NM_026714	Mm.347963	MAxx	101	0.35	0.38	0.45	-0.33	-0.38	0.48	1.11	1.18	0.57	iu
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705625	Rap1b	NM_024457	Mm.233009	MxBx	801	0.34	0.24	0.64	0.74	0.40	0.43	0.66	-0.01	0.56	iu
309451	Igtp	NM_018738	Mm.33902	MxBx	605	0.44	0.32	0.24	1.03	0.12	0.43	1.88	-0.01	0.49	iu
462877	Tes3-ps	NM_199056	Mm.260975	MxBI	505	0.62	0.45	0.22	1.09	0.29	-0.20	0.79	-0.01	0.04	iu
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319931	Mal2	NM_178920	Mm.34281	Mxxx	202	0.58	0.62	0.58	0.88	0.42	0.04	0.38	0.00	0.27	iu
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353467	Foxg1	NM_008241	Mm.4704	Mxxx	202	0.29	0.18	0.19	1.36	0.80	0.32	0.42	0.21	-0.18	iu
460998		BC065410	Mm.207555	MxBx	105	0.29	0.13	-0.05	0.72	0.15	0.07	0.63	0.22	0.29	iu
305143		BC046478	Mm.27103	MxBx	604	0.69	-0.20	-0.10	1.04	-0.40	0.28	0.52	0.22	0.10	iu
809382	Dido1	AK041630	Mm.253836	MAxI	201	-0.33	-0.16	0.12	0.99	0.34	-0.09	-0.10	0.22	0.58	iu
656987	Cdh2	AK086283	Mm.257437	MABI	202	0.30	0.60	0.13	1.28	0.60	0.11	0.61	0.22	0.49	iu
478646	Gpr64	NM_178712	Mm.213016	MxBI	502	0.54	-0.24	0.39	1.66	-0.42	0.25	-0.09	0.22	-0.11	iu
651773	5730455O13Rik	AK077572	Mm.30607	MxBx	401	0.60	0.34	0.14	0.76	0.37	-0.20	0.61	0.22	-0.24	iu
418641	Caskin2	NM_080643	Mm.383737	MxBx	105	0.69	0.18	-0.09	1.05	0.27	-0.06	0.71	0.22	0.22	iu
517006		AK039730	Mm.124886	MAxx	402	0.20	0.50	0.02	1.02	0.45	0.54	0.36	0.23	0.21	iu
873028	Mt3	NM_013603	Mm.2064	MxBx	501	0.59	-0.51	0.35	1.26	0.31	0.13	1.18	0.23	-0.21	iu
662862	D230037D09Rik	NM_177140	Mm.86546	MxBx	104	0.65	0.48	0.22	0.79	0.16	0.24	0.61	0.23	0.15	iu
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462436		NA		MxBx	1305	-0.09	-0.33	0.50	0.25	0.44	1.41	-0.37	-0.59	-0.47	r,u
537127	Olfr1377	NM_146911	Mm.377747	MxxI	401	0.49	0.06	-0.29	-0.20	0.32	1.00	-0.34	-0.11	0.38	r,u
605595	Stk32a	NM_178749	Mm.150401	MAxx	401	-0.35	0.36	-0.09	0.37	0.46	1.00	-0.34	0.12	0.55	r,u
676733		NM_175689		MAxx	401	0.50	-0.20	0.38	0.68	-0.21	1.60	-0.32	-0.08	-0.05	r,u
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872304	Mid2	NM_011845	Mm.131097	MxBI	101	-0.03	-0.22	-0.15	-0.01	-0.08	0.97	-0.27	0.30	-0.18	r,u
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732046	V1rg12	NM_134234	Mm.377220	MAxx	402	0.19	0.21	0.56	0.23	0.21	1.08	0.06	-0.24	0.58	r,u
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731749	Eif4b	NM_145625	Mm.290022	MxBx	1306	-0.15	-0.10	0.57	-0.37	0.16	0.88	0.09	-0.22	0.58	r,u
560696		NA		MxBx	1311	-0.56	0.15	0.59	0.01	0.13	1.25	0.09	0.46	0.64	r,u
585532		AK078087	Mm.384243	MxxI	401	0.60	0.33	0.18	0.05	0.38	1.29	0.10	0.28	0.44	r,u
661638		NM_177357		MABx	301	0.16	0.02	0.27	0.15	-0.02	0.79	0.12	-0.29	-0.09	r,u
574621	1700120K04Rik	BC028646	Mm.347960	MxBx	1207	0.04	0.43	0.62	-0.59	0.00	1.17	0.14	0.24	1.20	r,u
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356538		V00760		MxxI	401	-0.07	0.01	-0.33	0.11	0.09	0.78	0.19	-0.14	0.05	r,u
522359		NA		MxBx	1202	-0.16	0.01	0.49	0.31	0.27	0.85	0.19	-0.48	0.59	r,u
530947	Olfr1238	NM_146790	Mm.377690	MxBI	201	-0.05	0.45	-0.05	0.04	-0.35	1.69	0.19	0.01	0.47	r,u
437277	D930049A15Rik	AK086741	Mm.136515	MxBx	1103	0.42	0.12	0.17	0.25	0.29	1.23	0.20	-0.02	0.28	r,u
384341		AK019767	Mm.108536	MxxI	401	0.56	0.06	0.33	0.31	0.43	1.10	0.25	0.51	0.35	r,u
889776	Acas2l	NM_080575	Mm.7044	MxxI	401	0.41	0.33	-0.30	0.01	0.16	0.88	0.28	0.27	0.08	r,u
369690	Oprm1	AK038257	Mm.331674	MxxI	401	0.21	0.16	0.09	0.08	0.33	0.92	0.31	0.61	0.51	r,u
914789	Rab3a	NM_009001	Mm.5083	MxBx	901	0.05	0.23	0.29	0.70	-0.09	0.79	0.32	-0.22	0.13	r,u
730637	Hif3a	NM_016868	Mm.354757	MAxx	401	-0.11	0.07	-0.16	0.35	0.23	0.86	0.32	0.11	-0.14	r,u
554933		NA		MAxx	401	-0.09	-0.28	0.30	0.52	0.66	1.31	0.33	0.11	0.15	r,u
587464		AK038597	Mm.336710	MABx	103	0.06	0.48	0.11	0.10	0.65	0.85	0.38	0.47	0.55	r,u
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728847	F730004D16Rik	AK089465	Mm.277387	MxBI	102	0.37	-0.07	0.10	-0.32	0.02	0.96	0.44	0.35	0.07	r,u
785999	Ak1	NM_021515	Mm.29189	MxBx	1302	0.23	0.04	0.31	0.12	0.18	1.39	0.51	0.08	0.78	r,u
371090	BC050188	NM_177742	Mm.64542	MxBx	1006	0.22	0.60	0.23	-0.02	0.06	0.86	0.56	0.41	0.48	r,u
904228		NA		MxBx	1104	0.18	0.00	0.45	-0.01	-0.38	1.40	0.60	0.14	0.94	r,u
a Each value represents the fold change (in log2 value) versus the non-treated control. Seventy nine genes belong to both categories of injury- and recovery-specific genes.
b Eight ANOVA groups where A, B, I, x stands for dose, time, interaction, and blank, respectively.
c ANOVA cluster numbers classified to have approximately 25 genes per class.
c i, injury; r, recovery; d, down-regulated; u, up-regulated .